?诸葛亮病重之后，对自身的后事做了许多的准备，一方面他将蒋琬和费祎推荐给刘禅作为自己的后继者，另一方面在军中和秘密与长史杨仪、司马费祎、护军姜维等作身殁之后退军节度，令魏延断后。
不过关于杨仪和魏延之间的矛盾，诸葛亮却没有留下措施，使得自身去世后，蜀汉发生了一次不小的内斗。
诸葛亮在死前就已经曾经秘密上书给后主刘禅，说到：“臣如果出了什么意外，军国大事可以全部交给蒋琬。”
据《益部耆旧杂记》记载，建兴十二年，诸葛亮在五丈原病重，后主刘禅派李福前往问候，并向他征询国家大计。李福奉旨前往诸葛亮营地，与诸葛亮交谈。在离开营地回成都的路上，李福突然想起一件很重要的事，于是又掉头返回。
诸葛亮看见李福回来，笑着说：“我知道你会回来的。我们虽然交谈了一整天，但话还没有说完，你回来是还有一件事情要问。你所要问的人，蒋琬最合适了。”李福说：“那一天确实是忘了问，如您百年之后，谁可担任丞相的职务，所以我才立刻赶回来。那么，我还想再问一下，蒋琬之后，谁可继任丞相呢？”诸葛亮：“费祎可以继任。”李福又问：“那么费祎之后呢？”诸葛亮便默而不答了。李福回到成都，向后主刘禅交旨，转达了诸葛亮的话。
历史上诸葛亮为刘禅留下了两位后继者，其中一位是蒋琬，一位是费祎，二者都可以说是合格的，刘禅对于诸葛亮也是非常的信任，有两个人选还嫌不够，继续向诸葛亮询问第三人，然而蒋琬、费祎应该和刘禅是年龄应该相差不大，一般情况下第三人是很多余的，从诸葛亮的态度上来看，他也没有考虑过这方面。
但后来蒋琬因病早逝，费祎遭遇意外被刺杀，刘禅后期又依靠宦官，使得蜀汉内部风雨飘零，最终为曹魏所乘。
诸葛亮在死前除了将自己继承者推荐给刘禅之外，还对于军中事物和部下进行了商讨，并且做出相应的决定。当时诸葛亮病情加重，便秘密地与长史杨仪、司马费祎、护军姜维等讨论筹划他死后退军的安排，让魏延断后，姜维次之；若魏延不服从军令，便弃他不顾，军队照常行动。这个命令也为汉军日后的内斗埋下了伏笔。
诸葛亮留下遗命时，很可能已经没有多少时间了，而魏延当时作为先锋，并不在诸葛亮的营地，双方相距十里，所以魏延并没能参加这一次商讨。
在当时蜀汉北伐军内，毫无疑问是由诸葛亮掌管大权，在他之下，文官第一人应该就是长史杨仪，武将第一人就该以魏延为上了，然而二人却极为不和。据说当时前军师魏延与长史杨仪互相憎恶对方，每次并坐皆争论，魏延常举刀刃指向杨仪作威吓，杨仪则泣涕横集。
就算是诸葛亮本人对于他们的矛盾也没有什么太好的办法，当时诸葛亮深为爱惜杨仪的才干，又借助魏延的骁勇，常恨二人不能很好相处，但又不忍心偏废他们任何一方。司马费祎常介入二人坐间，为他们谏喻分别，以释其意，因此诸葛亮在世之时，可以各尽魏延、杨仪之所用者，费祎有一份很大的功劳。
结果就是诸葛亮死前，虽然留下了吩咐，但并没有解决魏延和杨仪之间矛盾，只是暂时搁置了魏延的事情，可能对于诸葛亮来说，当时杨仪也好，魏延也罢，对于蜀汉而言都是不可多得的人才，掌心掌背都是肉，他本人也难以取舍，所以干脆二者之间的事情，二者自己去解决吧。
现在颇为流传关于魏延反骨之事，在正史上并不可靠，说诸葛亮不重用魏延完全是骗人的，当时魏延的官职已经是前军师，兼任征西大将军，其军职非常高的，就算皇亲吴懿也不过左将军，魏延差不多是当时的蜀汉将领第一人。诸葛亮虽然没有采纳他的子午谷计谋，但对于魏延还是很重用和信任的，很多时候都让魏延作为先锋，或
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